La Shin-Ra ,una potente industria,cerca di arricchirsi estraendo dalla terra l'energia Mako.Questa e' di vitale importanza per la terra e, se ne viene estratta troppo,il pianeta rischia di morire.Quindi,un gruppo di ribelli,l'Avalance,cerca di contrastare la Shin-Ra.Uno dei componenti di questo gruppo di resistenza e' Cloud,il protagonista del gioco,ex soldier della Shin-Ra.La storia pero' gira soprattutto su un altro potentissimo ex soldier,Sephirot,che non fa parte ne' dell'Avalanche ne' della Shin-ra , ma sarà lui la vera minaccia per la terra.
