Il cavallo Appaloosa, noto per il caratteristico mantello maculato, trae le sue origini dall'accurata selezione che i pellerossa Nez Percé avevano eseguito, a partire dal XVII secolo, sulle rive del fiume Palouse. Alla riproduzione venivano ammessi solo gli esemplari migliori, sia morfologicamente, che per carattere e prestazioni. Nacque così un cavallo che permetteva di cacciare, di spostarsi velocemente lungo regioni impervie, ma anche dotato di resistenza e docilità.

Dopo la sconfitta dei Nez Percé ad opera dei militari, il 5 Ottobre 1877, i loro cavalli vennero dispersi, e finirono nelle mani di incompetenti pionieri, che con incroci maldestri causarono il declino della razza.

Agli inizi del secolo un giovane allevatore, Claude J. Thomson, riuscì a costruire un piccolo allevamento di Appaloosa, procedendo ad incroci con cavalli arabi di alcune fattrici Appaloosa, faticosamente recuperate visitando una per una le fattorie della regione di origine. Da allora gli Appaloosa sono stati selezionati permettendo l'apporto di sangue arabo, Quarter e Purosangue.

Nel 1938 Thomson, con un altro entusiasta degli Appaloosa, Francis Haines, fondò l'Appaloosa Horse Club.
Da allora gli Appaloosa si sono diffusi in tutto il mondo, entusiasmando per le loro doti di agilità, potenza, velocità e docilità, unite al particolare mantello che li rende unici.