Il centro di immersioni Nausicaa è supporto operativo per l'ambiente e le attività subacquee della Fondazione Mediterranea, organismo di promozione della ricerca scientifica interdisciplinare per la tutela del mare e delle sue risorse ed insieme sono attivi in programmi sull'ecosistema marino e sull'ecoturismo blu. E' anche autorizzato ad operare all'interno dell'area marina della riserva di Vendicari per attività scientifiche e ricreative.

Il centro di immersioni Nausicaa è attivo nell'ambito del programma di ricerca MedVeg in collaborazione con l'Università di Scienze di Ancona, l'Istituto di Biologia Marina di Odense (Danimarca), l'Istituto di Biologia Marina di Creta, il Dipartimento di Ecologia Marina di Silkeborg (Danimarca), l'Università di Biologia Marina di Barcellona (Spagna).

Il centro di immersioni Nausicaa ha anche collaborato con l'Istituto Talassografico di Messina (CNR) nel contesto del progetto europeo "Strategy" per campionamenti dei sedimenti e prelievi delle aree marine costiere.

Il centro di immersioni Nausicaa insieme all'  associazione Trireme hanno avviato  programmi di censimento di alcuni siti archeologici sommersi  nel compartimento marittimo di Siracusa. Si avvale di personale qualificato ad operare nell'ambito della immersioni scientifiche. Collabora con enti pubblici e privati in attività di monitoraggio e ricerca dell'ecosistema marino.