L’obiettivo essenziale del CETA è quello di creare una struttura scientifica a carattere internazionale in grado di mettere a confronto esperienze diverse su problemi ambientali ed ecologici dei Paesi industrializzati e di quelli in via di sviluppo. II CETA si propone inoltre come struttura di servizio, rivolta sia agli Enti pubblici che privati, in grado di fornire adeguate risposte nella gestione del territorio e delle sue risorse.

Il Centro è dotato di moderne strutture di ricerca, quali un laboratorio di microbiologia e chimica, un laboratorio GIS, campi e parcelle sperimentali, ecc. Il CETA attualmente dispone di tre sedi di cui due a Gorizia (il laboratorio chimico-microbiologico e gli uffici amministrativi e tecnici) ed una a Trieste, presso l’ AREA di Ricerca (laboratorio GIS e telerilevamento).