L'ospedale Santobono è sito nella zona collinare della città di Napoli, al limite tra il quartiere Vomero e l’Arenella. Vi si accede (per il Pronto Soccorso) da Via Mario Fiore, strada che congiunge Piazza Medaglie d’Oro e Piazza Bernini, e da via Ottavio Caiazzo (per i ricoveri e le prestazioni ambulatoriali) vedi piantina.

L’Ospedale può essere facilmente raggiunto attraverso le vie di collegamento più importanti quali:

la Struttura Semplice Dipartimentale di Fisiopatologia Oculare Neonatale è sita al terzo piano del padiglione "Ravaschieri", presso l'U.O. di Oculistica.