L'edifcio e qualificato dalla presenza di una volta a botte su pilastri nella navata certrale e volte a semibotti rampanti nelle navatelle: la zona del naos è sopraelevata rispetto al rimanente piano di calpestio e vi si accede per mezzo di alcuni gradini. Gli elementi distintivi, cioè volta a botte, semibotti rampanti e pilastri, sono peculiari di alcuni edifici dell'area salentina, per esempio San Salavtore presso Gallipoli, Santa Maria della Croce a Casaranello, San Giovanni di Patù ecc., che probabilmente trovano i loro prototipi nella vicina Grecia, dove in alcune zone si sono conservati a lungo, per esempio in Epiro. Ma è soprattutto la decorazione interna che fa della chiesa un vero unicum, nell'ambito della tradizione pittorica della Puglia "bizantina".
Legenda
1 Cristo fra due angeli
(in origine probabilmente
la Deisis);
2-5 Santi Padri della Chiesa;
6 Natività;
7 Presentazione al Tempio;
8 Battesimo;
9 Trasfigurazione (?);
10 Koimesis (?);
11 Ultima Cena;
12 Bacio di Giuda;
13 Crocifissione;
14 Pie Donne al Sepolcro;
15 Discesa al Limbo;
16-24 Clipei con Profeti
(non identificabili);
25 Il Profeta;
26 Il Profeta Gioele;
27 Il Profeta Abdia;
28 Il Profeta Isaia;
29 Il Profeta Amos (o Mosé);
30 Il Profeta Zaccaria;
31 Il Piofeta Giona;
32 Il Profeta Ezechiele;
33 Il Profeta Davide;
34 L'Evangelista Matteo;
35 L'Evangelista Luca;
36 L'Evangelista Marco (?);
37 L'Evangelista Giovanni (?);
38 Resti della testa di un Santo;
39 Sant'Eumenio;
40 Madonna con il Bambino;
41 Resti di una testa di Santo
(San Pietro?);
42 Asceta (Sant'Onufrio?);
43 San Simeone lo Stilita il
Vecchio;
44 San Giacomo l'Adelfoteo;
45 Santo Stefano;
46 San Macario l'Egiziano;
47 Resti di una aureola;
48 San Nicola;
49 San Teodoro Tirone;
50 San Luciano;
51 San Niceta;
52 San Gioannicio;
53 San Clemente di Ochrida;
54 San Paolo Apostolo;
55 Sant'Antonio eremita (?);
56 Resti di una testa;
57 Resti di figure stanti
(Elena e Costantino?);
58 Resti illeggibili;
59 Resti illegibili;
60 Resti di una figura con
cartiglio, probabilmente un santo
diacono (Stefano o Euplos).