Revil ha dato inizio all'operazione Odessa, che consiste nella distruzione di tutte le basi euroasiatiche di Ma Kube. Intanto Amuro esce con Seyla sul G-Armour in perlustrazione e vede un mezzo federale uscire da una base di Zion. Pensando si tratti di una spia lo segue sino alla nave federale Bigtray. Qui irrompe nella sala dove l'uomo alla guida del mezzo federale sta parlando con un suo superiore; accusatolo di tradimento, Amuro si vede puntare addosso la pistola anche dall'ufficiale: anch'egli evidentemente fa parte di un complotto ai danni della Federazione! Forunatamente Amuro viene salvato in extremis da alcuni soldati della Federazione. Ortega e Gaia, decisi a vendicare Mash, attaccano la White Base con i potenti Dom ed Amuro interviene in soccorso: dopo aver distrutto i due mezzi di Zion tuttavia riceve la segnalazione che Ma Kube,ormai sconfitto, ha deciso di ricorrere a due testate nucleari ignorando il Trattato del Polo Sud che ne vieta l'uso. Amuro riesce appena in tempo a separare con la spada laser i contatti tra le testate e i razzi vettori e a salvare la Terra dall'ennesima catastrofe.