L'A.P.A. è amministrata da un Consiglio Direttivo, eletto dall'Assemblea Generale dei Soci, sottoposto alla vigilanza di un Collegio Sindacale; le eventuali controversie tra Associati vengono vagliate da un Collegio dei Probi-Viri.
Il Consiglio Direttivo è composto da 15 Allevatori, 7 sono eletti dall'Assemblea ed 8 sono Presidenti delle Sezioni Specializzate di Razza e di Specie.
Il Presidente viene eletto dal Consiglio e scelto tra gli Allevatori di bovini in selezione genetica. 
E' coadiuvato  da  2 Vice-Presidenti. 
Guida per tre anni  l'Associazione Allevatori, determinandone le politiche gestionali, avvalendosi di un Direttore, che e' il responsabile interprovinciale dei Controlli Funzionali e dei Libri Genealogici e dei Registri Anagrafici delle diverse specie e razze allevate di interesse zootecnico.

Il Presidente è
Francesco Barberis, allevatore di Frisona Italiana, cuneese e conduttore  della Cascina "Cortazza"  di Cerrione (BI).

Il Direttore è
Ermanno Raffo, agronomo, biellese e residente nel comune di Crevacuore (BI)

Presidente onorario è Pietro Ramella, allevatore di Pezzata Rossa d'Oropa nella Cascina "Teresa" di Benna (BI). Attuale Vice-Presidente e' Guido Coda Zabetta, biellese, allevatore di Bruna Italiana, contitolare della Cascina "Airale" di Cossato (BI).